Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn5Q8CBA2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms