Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms