Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pnma1Q8C1C8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pnma1Q8C1C8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pnma1Q8C1C8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma1Q8C1C8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Pnma1Q8C1C8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pnma1Q8C1C8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma1Q8C1C8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms