Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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