Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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