Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim35Q8C006 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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