Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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