Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pdcl3Q8BVF2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcl3Q8BVF2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms