Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Zfp398Q8BV16 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Zfp398Q8BV16 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Zfp398Q8BV16 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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