Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnpy4Q8BQ47 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms