Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abraxas1Q8BPZ8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms