Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms