Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms