Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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