Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim6Q8BGE7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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