Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfascQ810U3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms