Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc172Q810N9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms