Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem39bQ810L4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms