Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NanogQ80Z64 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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