Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Pcsk9Q80W65 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcsk9Q80W65 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms