Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms