Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ube2q1Q7TSS2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ube2q1Q7TSS2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms