Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IfnkQ7TSL0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IfnkQ7TSL0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms