Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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