Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms