Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dsg1bQ7TSF1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dsg1bQ7TSF1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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