Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

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Length 745 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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