Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms