Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbno2Q7TNB8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms