Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox11Q7M6Y2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sox11Q7M6Y2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sox11Q7M6Y2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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