Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms