Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynmQ70IV5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms