Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc88cQ6VGS5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms