Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Atp8b3Q6UQ17 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms