Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms