Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt9Q6RHW0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt9Q6RHW0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms