Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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