Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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Zbtb40Q6PCS8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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Zbtb40Q6PCS8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Zbtb40Q6PCS8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Zbtb40Q6PCS8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Zbtb40Q6PCS8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Zbtb40Q6PCS8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Zbtb40Q6PCS8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Zbtb40Q6PCS8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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Zbtb40Q6PCS8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms