Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrp12Q6P5B0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms