Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms