Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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