Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms