Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ric1Q69ZJ7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms