Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf280dQ68FE8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms