Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja3Q64448 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms