Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl12Q62401 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms