Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpd52Q62393 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpd52Q62393 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms