Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Trim28Q62318 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim28Q62318 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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