Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf6Q62311 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf6Q62311 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms