Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ss18Q62280 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ss18Q62280 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms